河西学院工会是学校党委领导下教职工自愿结合的群众组织，是学校联系广大教职工的桥梁和纽带。河西学院工会，全称河西学院工会委员会。下设综合办公室和妇女工作部。目前共有会员3213人，其中教职工会员1387人、附属张掖人民医院会员1531人，全校共有23个基层工会。

河西学院发端于1941年创立的甘肃省立张掖师范学校；1958年成立张掖师范学院，1959年改办为张掖师范专科学校，1978年恢复张掖师范专科学校。是较早建立工会的学校之一。2000年原张掖农校和张掖地区职业中专并入，2001年升本改制为河西学院，2002年1月18日-20日召开河西学院第一届工会会员代表大会，选举产生河西学院工会第一届委员会。

2014年原张掖医学高等专科学校、张掖市人民医院并入，建成了以师、农、医三大民生学科为主的多学科协调发展的综合性应用型大学。原张掖医学高等专科学校和原张掖市人民医院工会委员会合并为工作班子，2014年12月21日召开了河西学院工会三届五次教职工代表大会暨工会会员代表大会。

2017年4月14日召开了河西学院第四届教职工代表大会暨工会会员代表大会第一次会议；2024年11月1日-2日召开了河西学院第五届教职工代表大会暨工会会员代表大会第一次会议。  

学校工会坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，学习贯彻习近平总书记关于工人阶级和工会工作的重要论述，在上级工会和学校党委领导下，在学校行政大力支持下，在广大教职工的积极配合下，围绕中心、服务大局，认真履行工会维护、教育、参与、建设四项职能，强化思想教育引领，坚持以教职工为本的工作理念，努力为教职工办实事、解难事，在维护教职工合法权益、促进学校民主管理、推进和谐校园建设、提升学校民主管理、加强和谐校园建设、提高教职工队伍素质、开展教书育人工作等方面取得了显著成效。先后被中共中央、国务院授予招生就业处“全国民族团结进步模范集体”称号，全国教科文卫系统授予“模范职工之家”称号，张掖市总工会授予全市工会工作“先进单位”，学校授予平安建设“先进单位”等荣誉称号。